SCGC全息基因解码系统
功能:可自动进行单细胞的分离和文库构建,带有数据库的软件分析生物信息,定性和定量分析。系统应用于各种单细胞转录组学:单细胞基因表达谱测序,单细胞CRISPR筛选测序,单细胞表面蛋白测序,单细胞VDJ全长测序,单细胞免疫图谱和抗原特异性测序分析。
样本类型: 微流体芯片能检测真核细胞(植物原生质细胞、悬浮细胞、组织、细胞核等)。
主机一体化:仪器一体化设置无需外置的上样系统,一体化主机可将样本和实验试剂上样到反应仓中,实现单细胞上样、分离、建库直至产生测序文库都在一个单元完成,实现全自动无人值守;
产品特点:
▪ 单细胞捕获实验操作流程:仪器每次运行时间20分钟,实现快速裂解细胞对基因表达影响最小,精确地获得转录组数据。
▪ 样本处理通量:仪器可同时运行 1-8 个通道,每次运行最多可产生80000 个单细胞的转录本。配套原厂多样本标记试剂,可完成细胞样本及细胞核样本混样建库,每个通道可支持10种样本标签,细胞样本混样单次实验可达到80个样本建库实验,细胞核样本混样单次实验可达80个样本建库实验;
▪ 利用抗体可以检测单细胞表面蛋白质鉴定分析方案和数据库。
▪ 单细胞细胞捕获效率:在样本细胞群体中捕获60%的细胞,每1000个细胞中含有双细胞的比例为0.9%在芯片内。
▪ 系统可以产生30万个独立的液滴反应体系。
▪ 单细胞捕获数量:每个样本可捕获100-10000个细胞.。
▪ 对于细胞系,根据细胞类型不同,每个细胞可检测基因数量5000个左右。
▪ 系统提供 Illumina 兼容测序文库和华大基因文库,建库样本满足 Illumina 测序仪和华大基因测序仪要求。
实现了高通量且再现性很高的分析。理论 上最多可以获得160000+个单细胞。另 外,一次可分注8种样品,分注在20钟左 右即可完成,将对细胞生存率的影响抑制 到最小。 |
成像阶段可以得到各个微孔的图像,使用专用的软件能够对得到的图像数据中各微孔内的细胞数进行检出,自动判断细胞的生死,因此可以减少数据需求,控制成本 |
分子barcode 芯片上各孔预先固相化了识别用 Barcode,Barcode序列种类达 数百万级能够AutoSect软件上的 细胞图像连接。 |
产品参数
类别 |
规格 |
分配量 |
50 nl 或100 nl,每纳米孔 |
软件 |
AutoSect软件 |
笔记本电脑 |
Windows 10,8 GB内存,320 GB的存储,1 GB网络适配器,USB端口的记忆棒 |
功率要求(对于不同的电网类型) |
120 VAC / 60 Hz电源:四个120 V,15或20A电路 |
220-240 VAC / 50 Hz电源:四个10A插座 |
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100 VAC / 50-60 Hz电源:四个15A插座 |
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保险丝 |
分配器;4AH,250V |
工作条件 |
电压要求:100-240 Vac, 50-60 Hz, 25 W 温度要求:18-28°C; 湿度要求:室温,不高于90%; |
组学研究 |
同时检测同一细胞的基因表达、及特异性免疫细胞或特异性抗原识别、细胞表面蛋白表达; 同时检测同一细胞中T细胞的α和β链配对信息和5’基因表达; 同时检测同一细胞中B细胞Ig重链轻链配对信息和5’基因表达; 可做到单细胞基因组染色质开放区域(ATAC-Seq) |
工作台空间 |
伸缩式抽屉,触摸屏界面,操作简便; 注意:工作台空间必须能够支撑110磅(50千克) |
软件 |
软件包括:分析软件和可视化软件,免费安装,免费升级; 分析软件及功能:提供操作简便、单机版一站式分析,结合转录比对数据和标示细胞的 barcode 信息,能进行细胞聚类、差异基因筛选、差异基因功能分析; 分析软件指定barcode列表用于分群计算、指定基因列表用于分群计算、指定PCA计算维度等等数据分析,5’基因表达和蛋白质功能预测; 可视化软件,分析寻找特征基因、鉴定细胞类型、探索子亚群、导出表达数据、差异数据、热图等; |
重量 |
44磅(20kg) |